Sequenzierung in großem Maßstab und De novo -Sequenzierung

Die Sequenzierung im großen Maßstab zielt häufig darauf ab, sehr lange DNA Stücke zu sequenzieren, wie dies durch ganze Chromosomen gezeigt wird, obwohl die Sequenzierung im großen Maßstab auf ähnliche Weise verwendet werden kann, um eine sehr große Anzahl kurzer Sequenzen zu erzeugen, wie in phage display gezeigt. Für längere Ziele, wie durch Chromosomen gezeigt, bestehen übliche Ansätze darin, große DNA -Fragmente in kürzere DNA -Fragmente zu schneiden (mit Begrenzungsenzymen) oder zu scheren (mit mechanischen Kräften). Das fragmentierte DNA kann dann in einen DNA -Vektor kloniert und in einem bakteriellen Wirt amplifiziert werden, wie durch Escherichia coli gezeigt. Kurz DNA Aus einzelnen Bakterienkolonien gereinigte Fragmente werden indikativ sequenziert und elektronisch zu einer langen, zusammenhängenden Verkettung zusammengesetzt. Studien haben gezeigt, dass das Hinzufügen eines Größenauswahlschritts zum Sammeln von DNA -Fragmenten einheitlicher Größe die Sequenzierungseffizienz und Genauigkeit der DNA Genomassemblierung verbessern kann. In diesen Studien hat sich die automatisierte Leimung als reproduzierbarer und präziser erwiesen als die manuelle Gelleimung.

Bild 149A | Ein Beispiel für die Ergebnisse der automatisierten Sequenzierung von Kettenabbrüchen DNA. | Abizar bei der englischen Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) von Wikimedia Commons

Bild 149A | Ein Beispiel für die Ergebnisse der automatisierten Sequenzierung von Kettenabbrüchen DNA. | Abizar bei der englischen Wikipedia / CC BY-SA (http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Radioactive_Fluorescent_Seq.jpg) von Wikimedia Commons

Autor : Milos Pawlowski

Referenzen:

Molekularbiologische Techniken I.

Werkzeuge der Molekularbiologie II

Kommentare